高速離心技術(shù)在生物學上應用
高速離心技術(shù)在生物學上應用
前言:離心技術(shù)在生物科學,特別是在生物化學和分子生物學研究領(lǐng)域,已得到十分廣泛的應用,每個生物化學和分子生物學實驗室都要裝備多種型式的離心機。離心技術(shù)主要用于各種生物樣品的分離和制備,生物樣品懸浮液在高速旋轉(zhuǎn)下,由于巨大的離心力作用,使懸浮的微小顆粒(細胞器、生物大分子的沉淀等)以一定的速度沉降,從而與溶液得以分離,而沉降速度取決于顆粒的質(zhì)量、大小和密度。
基本的工作原理
當一個粒子(生物大分子或細胞器)在高速旋轉(zhuǎn)下受到離心力作用時,此離心力“F”由下式定義,即:
F = m•a = m•ω2 r
a — 粒子旋轉(zhuǎn)的加速度, m — 沉降粒子的有效質(zhì)量,ω—粒子旋轉(zhuǎn)的角速度, r—粒子的旋轉(zhuǎn)半徑 cm 。
通常離心力常用地球引力的倍數(shù)來表示,因而稱為相對離心力 “ RCF ”?;蛘哂脭?shù)字乘“g”來表示,例如25000×g,則表示相對離心力為25000。相對離心力是指在離心場中,作用于顆粒的離心力相當于地球重力的倍數(shù),單位是重力加速度“g”
(980cm/sec2),此時“RCF”相對離心力可用下式計算:
∴ RCF = 1.119×10-5×rpm2 r
rpm — revolutions per minute每分鐘轉(zhuǎn)數(shù),r/min
由上式可見,只要給出旋轉(zhuǎn)半徑r,則RCF和rpm之間可以相互換算。但是由于轉(zhuǎn)頭的形狀及結(jié)構(gòu)的差異,使每臺離心機的離心管,從管口至管底的各點與旋轉(zhuǎn)軸之間的距離是不一樣的,所以在計算是規(guī)定旋轉(zhuǎn)半徑均用平均半徑“ra v”代替:
ra v= r min+rmax / 2
r的測量如下圖所示:
34º
rmin
旋轉(zhuǎn)軸 rav
rmax
一般情況下,低速離心時常以轉(zhuǎn)速“rpm”來表示,高速離心時則以“g” 表示。計算顆粒的相對離心力時,應注意離心管與旋轉(zhuǎn)軸中心的距離“r”不同,即沉降顆粒在離心管中所處位置不同,則所受離心力也不同。因此在報告超離心條件時,通??偸怯玫匦囊Φ谋稊?shù)“×g”代替每分鐘轉(zhuǎn)數(shù)“rpm”,因為它可以真實地反映顆粒在離心管內(nèi)不同位置的離心力及其動態(tài)變化??萍嘉墨I中離心力的數(shù)據(jù)通常是指其平均值(RCFa v),即離心管中點的離心力。
為便于進行轉(zhuǎn)速和相對離心力之間的換算,Dole 和Cotzias 利用RCF的計算公式,制作了轉(zhuǎn)速“rpm”、相對離心力“RCF”和旋轉(zhuǎn)半徑“r”三者關(guān)系的列線圖,圖式法比公式計算法方便(列線圖參見附錄)。換算時,先在r標尺上取已知的半徑和在rpm標尺上取已知的離心機轉(zhuǎn)數(shù),然后將這兩點間劃一條直線,與圖中RCF標尺上的交叉點即為相應的相對離心力數(shù)值。注意,若已知的轉(zhuǎn)數(shù)值處于rpm標尺的右邊,則應讀取RCF標尺右邊的數(shù)值,轉(zhuǎn)數(shù)值處于rpm標尺左邊,則應讀取RCF標尺左邊的數(shù)值。
離心機的主要構(gòu)造和類型
離心機可分為工業(yè)用離心機和實驗用離心機。實驗用離心機又分為制備性離心機和分析性離心機,制備性離心機主要用于分離各種生物材料,每次分離的樣品容量比較大,分析性離心機一般都帶有光學系統(tǒng),主要用于研究純的生物大分子和顆粒的理化性質(zhì),依據(jù)待測物質(zhì)在離心場中的行為(用離心機中的光學系統(tǒng)連續(xù)監(jiān)測),能推斷物質(zhì)的純度、形狀和分子量等。分析性離心機都是超速離心機。
1. 制備性離心機可分為三類:
⑴ 普通離心機:zui大轉(zhuǎn)速6000 rpm左右,zui大相對離心力近6000×g,容量為幾十毫升至幾升,分離形式是固液沉降分離,轉(zhuǎn)子有角式和外擺式,其轉(zhuǎn)速不能嚴格控制,通常不帶冷凍系統(tǒng),于室溫下操作,用于收集易沉降的大顆粒物質(zhì),如紅血球、酵母細胞等。這種離心機多用交流整流子電動機驅(qū)動,電機的碳刷易磨損,轉(zhuǎn)速是用電壓調(diào)壓器調(diào)節(jié),起動電流大,速度升降不均勻,一般轉(zhuǎn)頭是置于一個硬質(zhì)鋼軸上,因此地平衡離心管及內(nèi)容物就極為重要,否則會損壞離心機。
⑵ 高速冷凍離心機:zui大轉(zhuǎn)速為20000~25000rpm(r/min),zui大相對離心力為89000×g,zui大容量可達3升,分離形式也是固液沉降分離,轉(zhuǎn)頭配有各種角式轉(zhuǎn)頭、蕩平式轉(zhuǎn)頭、區(qū)帶轉(zhuǎn)頭、垂直轉(zhuǎn)頭和大容量連續(xù)流動式轉(zhuǎn)頭、一般都有制冷系統(tǒng),以消除高速旋轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)頭與空氣之間摩擦而產(chǎn)生的熱量,離心室的溫度可以調(diào)節(jié)和維持在0~40C,轉(zhuǎn)速、溫度和時間都可以嚴格準確地控制,并有指針或數(shù)字顯示,通常用于微生物菌體、細胞碎片、大細胞器、硫銨沉淀和免疫沉淀物等的分離純化工作,但不能有效地沉降病毒、小細胞器如核蛋白體或單個分子。
⑶ 超速離心機:轉(zhuǎn)速可達50000~80000 rpm,相對離心力zui大可達510000×g,zui的生產(chǎn)廠商有美國的貝克曼公司和日本的日立公司等,離心容量由幾十毫升至2升,分離的形式是差速沉降分離和密度梯度區(qū)帶分離,離心管平衡允許的誤差要小于0.1克。超速離心機的出現(xiàn),使生物科學的研究領(lǐng)域有了新的擴展,它能使過去僅僅在電子顯微鏡觀察到的亞細胞器得到分級分離,還可以分離病毒、核酸、蛋白質(zhì)和多糖等。
超速離心機主要由驅(qū)動和速度控制、溫度控制、真空系統(tǒng)和轉(zhuǎn)頭四部分組成。超速離心機的驅(qū)動裝置是由水冷或風冷電動機通過精密齒輪箱或皮帶變速,或直接用變頻感應電機驅(qū)動,并由微機進行控制,由于驅(qū)動軸的直徑較細,因而在旋轉(zhuǎn)時此細軸可有一定的彈性彎曲,以適應轉(zhuǎn)頭輕度的不平衡,而不致于引起震動或轉(zhuǎn)軸損傷,除速度控制系統(tǒng)外,還有一個過速保護系統(tǒng),以防止轉(zhuǎn)速超過轉(zhuǎn)頭zui大規(guī)定轉(zhuǎn)速而引起轉(zhuǎn)頭的撕裂或爆炸,為此,離心腔用能承受此種爆炸的裝甲鋼板密閉。
溫度控制是由安裝在轉(zhuǎn)頭下面的紅外線射量感受器直接并連續(xù)監(jiān)測離心腔的溫度,以保證更準確更靈敏的溫度調(diào)控,這種紅外線溫控比高速離心機的熱電偶控制裝置更敏感,更準確。
超速離心機裝有真空系統(tǒng),這是它與高速離心機的主要區(qū)別。離心機的速度在2000 rpm以下時,空氣與旋轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)頭之間的磨擦只產(chǎn)生少量的熱,速度超過20000 rpm時,由磨擦產(chǎn)生的熱量顯著增大,當速度在40000 rpm以上時,由磨擦產(chǎn)生的熱量就成為嚴重問題,為此,將離心腔密封,并由機械泵和擴散泵串聯(lián)工作的真空泵系統(tǒng)抽成真空,溫度的變化容易控制,磨擦力很小,這樣才能達到所需的超高轉(zhuǎn)速。
2. 轉(zhuǎn)頭:
⑴ 角式轉(zhuǎn)頭:角式轉(zhuǎn)頭是指離心管腔與轉(zhuǎn)軸成一定傾角的轉(zhuǎn)頭。它是由一塊完整的金屬制成的,其上有4~12個裝離心管用的機制孔穴,即離心管腔,孔穴的中心軸與旋轉(zhuǎn)軸之間的角度在20~40度之間,角度越大沉降越結(jié)實,分離效果越好。這種轉(zhuǎn)頭的優(yōu)點是具有較大的容量,且重心低,運轉(zhuǎn)平衡,壽命較長,顆粒在沉降時先沿離心力方向撞向離心管,然后再沿管壁滑向管底,因此管的一側(cè)就會出現(xiàn)顆粒沉積,此現(xiàn)象稱為“壁效應”,壁效應容易使沉降顆粒受突然變速所產(chǎn)生的對流擾亂,影響分離效果。
⑵ 蕩平式轉(zhuǎn)頭:這種轉(zhuǎn)頭是由吊著的4或6個自由活動的吊桶(離心套管)構(gòu)成。當轉(zhuǎn)頭靜止時,吊桶垂直懸掛,當轉(zhuǎn)頭轉(zhuǎn)速達到每分鐘200到800轉(zhuǎn)時,吊桶蕩至水平位置,這種轉(zhuǎn)頭做密度梯度區(qū)帶離心,其優(yōu)點是梯度物質(zhì)可放在保持垂直的離心管中,離心時被分離的樣品帶垂直于離心管縱軸,而不像角式轉(zhuǎn)頭中樣品沉淀物的界面與離心管成一定角度,因而有利于離心結(jié)束后由管內(nèi)分層取出已分離的各樣品帶。其缺點是顆粒沉降距離長,離心所需時間也長。
⑶ 區(qū)帶轉(zhuǎn)頭:區(qū)帶轉(zhuǎn)頭無離心管,主要由一個轉(zhuǎn)子桶和可旋開的頂蓋組成,轉(zhuǎn)子桶中裝有十字型隔板裝置,把桶內(nèi)分隔成四個或多個扇形小室,隔板內(nèi)有導管,梯度液或樣品液從轉(zhuǎn)頭中央的進液管泵入,通過這些導管分布到轉(zhuǎn)子四周,轉(zhuǎn)頭內(nèi)的隔板可保持樣品帶和梯度介質(zhì)的穩(wěn)定。沉降的樣品顆粒在區(qū)帶轉(zhuǎn)頭中的沉降情況不同于角式和外擺式轉(zhuǎn)頭,在徑向的散射離心力作用下,顆粒的沉降距離不變,因此區(qū)帶轉(zhuǎn)頭的“壁效應”極小,可以避免區(qū)帶和沉降顆粒的紊亂,分離效果好,而且還有轉(zhuǎn)速高,容量大,回收梯度容易和不影響分辨率的優(yōu)點,使超離心用于制備和工業(yè)生產(chǎn)成為可能。區(qū)帶轉(zhuǎn)頭的缺點是樣品和介質(zhì)直接接觸轉(zhuǎn)頭,耐腐蝕要求高,操作復雜。
⑷ 垂直轉(zhuǎn)頭:其離心管是垂直放置,樣品顆粒的沉降距離zui短,離心所需時間也短,適合用于密度梯度區(qū)帶離心,離心結(jié)束后液面和樣品區(qū)帶要作九十度轉(zhuǎn)向,因而降速要慢。
⑸ 連續(xù)流動轉(zhuǎn)頭:可用于大量培養(yǎng)液或提取液的濃縮與分離,轉(zhuǎn)頭與區(qū)帶轉(zhuǎn)頭類似,由轉(zhuǎn)子桶和有入口和出口的轉(zhuǎn)頭蓋及附屬裝置組成,離心時樣品液由入口連續(xù)流入轉(zhuǎn)頭,在離心力作用下,懸浮顆粒沉降于轉(zhuǎn)子桶壁,上清液由出口流出。
3. 離心管:
離心管主要用塑料和不銹鋼制成,塑料離心管常用材料有聚乙烯(PE),聚碳酸酯(PC),聚丙烯(PP)等,其中PP管性能較好。塑料離心管的優(yōu)點是透明(或半透明),硬度小,可用穿刺法取出梯度。缺點是易變形,抗有機溶劑腐蝕性差,使用壽命短。
不銹鋼管強度大,不變形,能抗熱,抗凍,抗化學腐蝕。但用時也應避免接觸強腐蝕性的化學藥品,如強酸、強堿等。
塑料離心管都有管蓋,離心前管蓋必須蓋嚴,倒置不漏液。管蓋有三種作用:
①防止樣品外泄。用于有放射性或強腐蝕性的樣品時,這點尤其重要。②防止樣
品揮發(fā)。③支持離心管,防止離心管變形。
4. 分析性離心機:
分析性離心機使用了特殊設計的轉(zhuǎn)頭和光學檢測系統(tǒng),以便連續(xù)地監(jiān)視物質(zhì)在一個離心場中的沉降過程。從而確定其物理性質(zhì)。
分析性超速離心機的轉(zhuǎn)頭是橢圓形的,以避免應力集中于孔處。此轉(zhuǎn)頭通過一個有柔性的軸聯(lián)接到一個高速的驅(qū)動裝置上,轉(zhuǎn)頭在一個冷凍的和真空的腔中旋轉(zhuǎn),轉(zhuǎn)頭上有2~6個裝離心杯的小室,離心杯是扇形石英的,可以上下透光,離心機中裝有一個光學系統(tǒng),在整個離心期間都能通過紫外吸收或折射率的變化監(jiān)測離心杯中沉降著的物質(zhì),在預定的期間可以拍攝沉降物質(zhì)的照片,在分析離心杯中物質(zhì)沉降情況時,在重顆粒和輕顆粒之間形成的界面就像一個折射的透鏡,結(jié)果在檢測系統(tǒng)的照像底板上產(chǎn)生了一個“峰”,由于沉降不斷進行,界面向前推進,因此峰也移動,從峰移動的速度可以計算出樣品顆粒的沉降速度。
分析性超速離心機和主要特點就是能在短時間內(nèi),用少量樣品就可以得到一些重要信息,能夠確定生物大分子是否存在,其大致的含量,計算生物大分子的沉降系數(shù),結(jié)合界面擴散,估計分子的大小,檢測分子的不均一性及混合物中各組份的比例,測定生物大分子的分子量,還可以檢測生物大分子的構(gòu)象變化等。
制備性超速離心的分離方法:
1. 差速沉降離心法:
這是zui普通的離心法。即采用逐漸增加離心速度或低速和高速交替進行離心,使沉降速度不同的顆粒,在不同的離心速度及不同離心時間下分批分離的方法。此法一般用于分離沉降系數(shù)相差較大的顆粒。
差速離心首先要選擇好顆粒沉降所需的離心力和離心時間。當以一定的離心力在一定的離心時間內(nèi)進行離心時,在離心管底部就會得到zui大和zui重顆粒的沉淀,分出的上清液在加大轉(zhuǎn)速下再進行離心,又得到第二部分較大較重顆粒的沉淀及含較小和較輕顆粒的上清液,如此多次離心處理,即能把液體中的不同顆粒較好地分離開。此法所得的沉淀是不均一的,仍雜有其它成分,需經(jīng)過2~3次的再懸浮和再離心,才能得到較純的顆粒。
此法主要由于組織勻漿液中分離細胞器和病毒,其優(yōu)點是:操作簡易,離心后用傾倒法即可將上清液與沉淀分開,并可使用容量較大的角式轉(zhuǎn)子。缺點是:須多次離心,沉淀中有夾帶,分離效果差,不能一次得到純顆粒,沉淀于管底的顆粒受擠壓,容易變性失活。
2. 密度梯度區(qū)帶離心法(簡稱區(qū)帶離心法):
區(qū)帶離心法是將樣品加在惰性梯度介質(zhì)中進行離心沉降或沉降平衡,在一定的離心力下把顆粒分配到梯度中某些特定位置上,形成不同區(qū)帶的分離方法。此法的優(yōu)點是:①分離效果好,可一次獲得較純顆粒;②適應范圍廣,能象差速離心法一樣分離具有沉降系數(shù)差的顆粒,又能分離有一定浮力密度差的顆粒;③顆粒不會擠壓變形,能保持顆?;钚?,并防止已形成的區(qū)帶由于對流而引起混合。
此法的缺點是:①離心時間較長;②需要制備惰性梯度介質(zhì)溶液;③操作嚴格,不易掌握。
密度梯度區(qū)帶離心法又可分為兩種:
(1)差速區(qū)帶離心法:當不同的顆粒間存在沉降速度差時(不需要像差速沉降離心法所要求的那樣大的沉降系數(shù)差)。在一定的離心力作用下,顆粒各自以一定的速度沉降,在密度梯度介質(zhì)的不同區(qū)域上形成區(qū)帶的方法稱為差速區(qū)帶離心法。此法僅用于分離有一定沉降系數(shù)差的顆粒(20% 的沉降系數(shù)差或更少)或分子量相差3倍的蛋白質(zhì),與顆粒的密度無關(guān),大小相同,密度不同的顆粒(如線粒體,溶酶體等)不能用此法分離。
離心管先裝好密度梯度介質(zhì)溶液,樣品液加在梯度介質(zhì)的液面上,離心時,由于離心力的作用,顆粒離開原樣品層,按不同沉降速度向管底沉降,離心一定時間后,沉降的顆粒逐漸分開,zui后形成一系列界面清楚的不連續(xù)區(qū)帶,沉降系數(shù)越大,往下沉降越快,所呈現(xiàn)的區(qū)帶也越低,離心必須在沉降zui快的大顆粒到達管底前結(jié)束,樣品顆粒的密度要大于梯度介質(zhì)的密度。梯度介質(zhì)通常用蔗糖溶液,其zui大密度和濃度可達1.28 kg/cm3和60%。
此離心法的關(guān)鍵是選擇合適的離心轉(zhuǎn)速和時間
(2)等密度區(qū)帶離心法:離心管中預先放置好梯度介質(zhì),樣品加在梯度液面上,或樣品預先與梯度介質(zhì)溶液混合后裝入離心管,通過離心形成梯度,這就是預形成梯度和離心形成梯度的等密度區(qū)帶離心產(chǎn)生梯度的二種方式。
離心時,樣品的不同顆粒向上浮起,一直移動到與它們的密度相等的等密度點的特定梯度位置上,形成幾條不同的區(qū)帶,這就是等密度離心法。體系到達平衡狀態(tài)后,再延長離心時間和提高轉(zhuǎn)速已無意義,處于等密度點上的樣品顆粒的區(qū)帶形狀和位置均不再受離心時間所影響,提高轉(zhuǎn)速可以縮短達到平衡的時間,離心所需時間以zui小顆粒到達等密度點(即平衡點)的時間為基準,有時長達數(shù)日。
等密度離心法的分離效率取決于樣品顆粒的浮力密度差,密度差越大,分離效果越好,與顆粒大小和形狀無關(guān),但大小和形狀決定著達到平衡的速度、時間和區(qū)帶寬度。
等密度區(qū)帶離心法所用的梯度介質(zhì)通常為氯化絕CSCl,其密度可達1.7 g/cm3。此法可分離核酸、亞細胞器等,也可以分離復合蛋白質(zhì),但簡單蛋白質(zhì)不適用。
收集區(qū)帶的方法有許多種,例如:
(1) 用注射器和滴管由離心管上部吸出。
(2) 有針刺穿離心管底部滴出。
(3) 用針刺穿離心管區(qū)帶部份的管壁,把樣品區(qū)帶抽出。
(4)用一根細管插入離心管底,泵入超過梯度介質(zhì)zui大密度的取代液,將樣品和梯度介質(zhì)壓出,用自動部分收集器收集。
離心操作的注意事項
高速與超速離心機是生化實驗教學和生化科研的重要精密設備,因其轉(zhuǎn)速高,產(chǎn)生的離心力大,使用不當或缺乏定期的檢修和保養(yǎng),都可能發(fā)生嚴重事故,因此使用離心機時都必須嚴格遵守操作規(guī)程。
1. 使用各種離心機時,必須事先在天平上精密地平衡離心管和其內(nèi)容物,平衡時重量之差不得超過各個離心機說明書上所規(guī)定的范圍,每個離心機不同的轉(zhuǎn)頭有各自的允許差值,轉(zhuǎn)頭中不能裝載單數(shù)的管子,當轉(zhuǎn)頭只是部分裝載時,管子必須互相對稱地放在轉(zhuǎn)頭中,以便使負載均勻地分布在轉(zhuǎn)頭的周圍。
2. 裝載溶液時,要根據(jù)各種離心機的具體操作說明進行,根據(jù)待離心液體的性質(zhì)及體積選用適合的離心管,有的離心管無蓋,液體不得裝得過多,以防離心時甩出,造成轉(zhuǎn)頭不平衡、生銹或被腐蝕,而制備性超速離心機的離心管,則常常要求必須將液體裝滿,以免離心時塑料離心管的上部凹陷變形。每次使用后,必須仔細檢查轉(zhuǎn)頭,及時清洗、擦干,轉(zhuǎn)頭是離心機中須重點保護的部件,搬動時要小心,不能碰撞,避免造成傷痕,轉(zhuǎn)頭長時間不用時,要涂上一層上光臘保護,嚴禁使用顯著變形、損傷或老化的離心管。
3. 若要在低于室溫的溫度下離心時。轉(zhuǎn)頭在使用前應放置在冰箱或置于離心機的轉(zhuǎn)頭室內(nèi)預冷。
4. 離心過程中不得隨意離開,應隨時觀察離心機上的儀表是否正常工作,如有異常的聲音應立即停機檢查,及時排除故障。
5. 每個轉(zhuǎn)頭各有其zui高允許轉(zhuǎn)速和使用累積*,使用轉(zhuǎn)頭時要查閱說明書,不得過速使用。每一轉(zhuǎn)頭都要有一份使用檔案,記錄累積的使用時間,若超過了該轉(zhuǎn)頭的zui高使用*,則須按規(guī)定降速使用。
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